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祝賀澳門科技大學馬文哲老師課題組在Virus Research(影響因子IF: 3.3033)發表論文

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新冠病毒(SARS-CoV-2)的快速演變導致COVID-19疾病在全球迅速傳播。特別是編碼刺突蛋白的基因突變,幫助病毒適應和逃避了人類的免疫係統,影響了免疫和治療的效果。攜帶刺突蛋白D614G氨基酸變化的SARS-CoV-2變異株是本次大流行中最占優勢的毒株。 因此,有效檢測包括D614G突變在內的SARS-CoV-2變異對控製COVID-19大流行至關重要。本研究報告了一種雙合成錯配CRISPR/Cas12a (dsmCRISPR)方法,用於檢測SARS-CoV-2 D614G突變,具有較高的敏感性和特異性。通過靶向SARS-CoV-2 D614G突變,在突變位點周圍-3到+3位置設計合成錯配crRNAs。為了提高靈敏度和特異性,在研究中采用合成的與D614G點突變位點具有3′端堿基互補和3′端堿基相鄰的錯配引物,對具有較高退火溫度的D614G突變位點進行特異性擴增。利用合成錯配crRNA-(-1),G614與D614之間的熒光比更高,可以達到13.45。 結合錯配引物擴增D614G突變時,檢測到的G614/D164模板熒光比增加了73.53%,達到23.12。本研究中的方法可檢測SARS-CoV-2 D614G突變核酸,靈敏度高,並用人工合成的SARS-CoV-2 D614G RNA進行驗證。因此,dsmCRIPSR方法有很大的潛力成為一種敏感和特異的檢測方法用於檢測SARS-CoV-2 D614G,並可以進一步擴展到其他感興趣的SARS-CoV-2變異株的檢測。


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CRISPR是一種出色的基因組編輯工具,比較熟悉的是來自化膿鏈球菌的Cas9(SpCas9),不過這並不是唯一的選擇。一種新型核酸酶Cas13a(以前稱為C2c2)正開始進入人們的視野,它具有獨特的性質,進一步擴展了CRISPR工具箱。


惠誠生物提供的提供的cas酶包括:

CRISPR-Cas13a

重組CRISPR-Cas12a蛋白 Recombinant CRISPR-Cas12a protein

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